檢測腫瘤釋放進(jìn)入血液中的游離DNA（cfDNA，cell-free DNA）的突變是一種極具潛力的癌癥檢測方法。然而這類檢測的敏感性和準(zhǔn)確性及其檢測早期癌癥的能力目前仍然處于低水平【1-4】。一種潛在的替代方法是檢測cfDNA上的甲基化水平，因?yàn)樵谀[瘤中，DNA甲基化水平會發(fā)生顯著的變化。
早期的全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing，BS-Seq)盡管有在cfDNA上測試過，然而由于在DNA在重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換（bisulfite conversion）過程中有將近84-96%會降解【5】，并且面臨成本高、信息覆蓋有限等問題。因此，發(fā)展一種可以敏感檢測游離DNA甲基化并且能進(jìn)行高通量測序的技術(shù)顯得十分有意義。
11月15日，來自加拿大多倫多大學(xué)健康網(wǎng)絡(luò)（University Health Network）的研究人員在Nature發(fā)表了題為Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes的研究論文，描述了一種可以敏感檢測癌癥DNA甲基化的技術(shù)。雖然該技術(shù)還需要通過獨(dú)立樣本驗(yàn)證該研究結(jié)果，但是這些發(fā)現(xiàn)有望改進(jìn)非侵入式癌癥檢測。
在這項(xiàng)研究中，Daniel De Carvalho及同事開發(fā)了一種分離、檢測和描述低水平DNA甲基化的技術(shù)，即“游離DNA甲基化免疫共沉淀測序”（cell-free methylated DNA immunoprecipitation and high-throughput sequencing，cfMeDIP-seq）。該技術(shù)可以敏感地檢測低水平的DNA甲基化（DNA使用量可以低至100ng），而且與其它已有檢測手段相比仍不失準(zhǔn)確性。
該研究稱，該檢測技術(shù)能夠區(qū)分24名早期 胰 腺癌患者和健康對照組的cfDNA中的DNA甲基化。此外，對于388個(gè)來自7種不同腫瘤（急性髓性白血病、 胰 腺癌、結(jié)腸癌、乳腺癌、肺癌、腎癌和膀胱癌）和健康供體的樣本，該檢測技術(shù)能夠鑒定出可以區(qū)分不同癌癥的特定甲基化譜。
對于cfMeDIP-seq技術(shù)來說，雖然還需要開展進(jìn)一步的研究加以驗(yàn)證，但是上述研究突顯了cfDNA甲基化譜用以準(zhǔn)確檢測多種早期癌癥的潛力。
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