Cell Res：同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院團(tuán)隊揭示Isl1在心肌細(xì)胞凋亡表觀遺傳控制中的關(guān)鍵作用

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來源：生物探索

2019-04-28

從單個全能受精卵產(chǎn)生廣泛不同和特化的細(xì)胞類型涉及大規(guī)模轉(zhuǎn)錄變化和染色質(zhì)重組。先鋒轉(zhuǎn)錄因子在編程表觀基因組中起關(guān)鍵作用，并在連續(xù)細(xì)胞譜系規(guī)范和分化步驟中促進(jìn)其他調(diào)節(jié)因子的募集。2019年4月25號，同濟(jì)大學(xué)心律失常教育部重點實驗室、同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院課題組長孫云甫教授、梁興群教授團(tuán)隊等在Cell Research上在線發(fā)表了題為Pioneering function of Isl1 in the epigenetic control of cardiomyocyte cell fate的研究論文。該研究揭示Isl1 / Brg1-Baf60c復(fù)合物在協(xié)調(diào)心臟發(fā)生和建立心肌細(xì)胞命運的表觀遺傳記憶中起著至關(guān)重要的作用。

干細(xì)胞/祖細(xì)胞分化為不同的譜系涉及到一系列大規(guī)模的轉(zhuǎn)錄變化和染色質(zhì)重組。組織特異性轉(zhuǎn)錄因子與表觀遺傳修飾因子協(xié)同作用對表觀基因組進(jìn)行編程，建立細(xì)胞同一性，這是由表觀遺傳調(diào)控機制進(jìn)一步維持的。為了啟動細(xì)胞程序設(shè)計，一種特殊類型的轉(zhuǎn)錄因子，即先鋒轉(zhuǎn)錄因子，將發(fā)育沉默的基因嵌入在細(xì)胞核覆蓋的“封閉”染色質(zhì)中。先鋒因子本身不足以激活基因，但它賦予染色質(zhì)開放轉(zhuǎn)錄的能力。染色質(zhì)開放有助于隨后招募額外的轉(zhuǎn)錄因子和其他調(diào)節(jié)蛋白，這些蛋白協(xié)同工作，在譜系說明和心臟發(fā)生過程中的一系列步驟中誘導(dǎo)細(xì)胞類型特異性基因表達(dá)程序，多個轉(zhuǎn)錄因子相互配合，并整合在調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中，這些網(wǎng)絡(luò)嚴(yán)格控制著確保心臟正常發(fā)育的轉(zhuǎn)錄程序。

Isl 1是一種LIM-同源結(jié)構(gòu)域轉(zhuǎn)錄因子，在分化和整合到心臟管之前，在SHF祖細(xì)胞中瞬時表達(dá)。這些細(xì)胞被添加到心臟管的動脈和靜脈極，從而使其持續(xù)生長，并形成復(fù)雜的形態(tài)發(fā)生模式SHF心臟祖細(xì)胞(CPCs)的部署和分化在很大程度上是造成人類先天性心臟畸形的主要原因，這凸顯了更全面地了解SHF介導(dǎo)的心臟發(fā)育的機制的重要性。從小鼠的遺傳學(xué)研究可以看出，Isl 1在SHF發(fā)展中的關(guān)鍵作用，表明Isl 1缺陷小鼠胚胎缺乏從SHF中提取的所有結(jié)構(gòu)，包括右心室(RV)、流出道(OFT)和大部分心房，因為Isl 1是SHF CPC的增殖、存活、遷移及其分化為不同心臟線的必要條件。最近的研究發(fā)現(xiàn)Isl 1變異體和缺失與先天性心臟病有關(guān)。盡管Isl 1在心臟發(fā)育和疾病中起著關(guān)鍵作用，但對其分子作用模式的詳細(xì)見解卻嚴(yán)重缺失。

在這里，研究顯示Isl1通過塑造心臟祖細(xì)胞的染色質(zhì)景觀，作為驅(qū)動心肌細(xì)胞譜系的先驅(qū)因素。使用顯示先天性心臟缺陷的Isl1亞型小鼠系列，Isl1結(jié)合的基因組范圍分析以及心臟祖細(xì)胞及其衍生物的RNA-和ATAC-測序，揭示了Isl1下游的調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，其協(xié)調(diào)心臟發(fā)生。在機制上，研究顯示Isl1與壓縮的染色質(zhì)結(jié)合并與基于Brg1-Baf60c的SWI / SNF復(fù)合物協(xié)同工作，以促進(jìn)染色質(zhì)景觀中允許的心臟譜系特異性改變，不僅是在心臟祖細(xì)胞中具有關(guān)鍵功能的基因，而且還有當(dāng)Isl1本身不再存在時高度表達(dá)的心肌細(xì)胞結(jié)構(gòu)基因。因此，Isl1 / Brg1-Baf60c復(fù)合物在協(xié)調(diào)心臟發(fā)生和建立心肌細(xì)胞命運的表觀遺傳記憶中起著至關(guān)重要的作用。

馬克斯普朗克心肺研究所Gergana Dobreva教授和加州大學(xué)圣地亞哥分校Sylvia M. Evans教授共同合作完成該研究。本研究得到了國家自然科學(xué)基金的支持。

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