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時(shí)隔3年后,韓春雨發(fā)布科研成果論文

熱門推薦: NgAgo 基因編輯 韓春雨
來源:生物世界 中國(guó)科學(xué)報(bào) 醫(yī)谷綜合
  2019-07-19
時(shí)隔3年,曾處于輿論旋渦的韓春雨公開了一項(xiàng)最新研究成果。近日,韓春雨在預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv上發(fā)表了一篇關(guān)于基因編輯的新文章:Background free tracking of single RNA in living cells using catalyically inactive CasE。

       時(shí)隔3年,曾處于輿論旋渦的韓春雨公開了一項(xiàng)最新研究成果。

       近日,韓春雨在預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv上發(fā)表了一篇關(guān)于基因編輯的新文章:Background free tracking of single RNA in living cells using catalytically inactive CasE。

新文章

       文章共有5名作者,依次為Feng Gao, Yue Sun, Feng Jiang, Xiaoyue Bai, Chunyu Han,工作單位均為河北科技大學(xué)基因編輯研究中心。其中,韓春雨為通訊作者。

       論文中提到的CasE是Ⅰ-E型 CRISPR復(fù)合物的核心成分,它通過結(jié)合特定的莖環(huán)區(qū)域單獨(dú)處理pre-crRNA,稱之為 CasE Binding S,簡(jiǎn)稱為CBS。CasE保守His20參與催化活性,ΔHis26-TtCse3突變的CasE(dCasE)則失去了催化活性,但仍然與其靶標(biāo)緊密結(jié)合。

       在該研究中,通過將 split 熒光與dCasE的N端和C-末端(ΔHis20)融合,構(gòu)建了活體RNA跟蹤工具VN-dCasE-VC。該系統(tǒng)僅在存在靶RNA時(shí)才發(fā)出熒光,從而增強(qiáng)信噪比。

       在活細(xì)胞中進(jìn)行可視化的RNA追蹤,不需要特定的亞細(xì)胞分布。CasE-GFP和dCasE-GFP在HEK293T細(xì)胞中的高水平表達(dá)和均勻分布表明CasE和dCasE適合于活細(xì)胞中的RNA操作。

       為了測(cè)試CasE在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中表達(dá)時(shí)是否具有強(qiáng)活性,作者構(gòu)建了“關(guān)閉”報(bào)告基因質(zhì)粒CBS-GFP-N1。它由5′-UTR中的GFP mRNA和CasE結(jié)合位點(diǎn)(CBS)組成。當(dāng)CasE被引入系統(tǒng)時(shí),GFP表達(dá)水平急劇下降。

       同時(shí),為了進(jìn)一步測(cè)試CasE活性,作者還構(gòu)建了“開啟”報(bào)告基因質(zhì)粒RED-16×CBS-Lin28-C1,其中CBS插入RED單體基因的3′-UTR區(qū)和Lin28的上游。Lin28是RNA核保留信號(hào),在其3′-UTR中具有l(wèi)in28信號(hào)的RED單體mRNA幾乎不能翻譯成蛋白質(zhì)。

       CBS-CasE依賴限制性切斷l(xiāng)in28信號(hào)并從核釋放靶mRNA用于翻譯(圖1E和圖1F)。這些表明CasE可以結(jié)合并切割哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的CBS。

       另外,為了將dCasE-CBS相互作用設(shè)計(jì)到RNA追蹤系統(tǒng)中,作者通過將split-FP5-7與dCasE蛋白結(jié)合。發(fā)現(xiàn)一個(gè)版本,即VN-dCasE-VC很難發(fā)出熒光,這可能是由于不正確的折疊或不穩(wěn)定的狀態(tài),但是當(dāng)與靶RNA(CBS)結(jié)合時(shí),可以在熒光顯微鏡下清楚地捕獲熒光信號(hào),即使VN-dCasE-VC表達(dá)質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染劑量非常低。

       接下來,作者使用VN-dCasE-VC系統(tǒng)追蹤哺乳動(dòng)物細(xì)胞中過表達(dá)的β-肌動(dòng)蛋白(β-Actin)的mRNA,VN-dCasE-VC系統(tǒng)在細(xì)胞質(zhì)中顯示出強(qiáng)熒光。此外還觀察到,向靶mRNA添加更多CBS可改善信號(hào),熒光追蹤更清晰,因此,可以通過增加CBS的數(shù)量來檢測(cè)低豐度的mRNA。

       總的來說,韓春雨團(tuán)隊(duì)發(fā)明了一種新的RNA追蹤工具,將其命名為VN-dCasE-VC,該系統(tǒng)能夠追蹤活細(xì)胞中沒有背景的特定RNA,通過熒光將其可視化。

       目前已有兩種活細(xì)胞RNA追蹤成像工具,一種是MS2,一種是Cas13a,韓春雨團(tuán)隊(duì)開發(fā)的dCasE系統(tǒng),成像效果由于MS2,而且,dCasE蛋白的分子量為22kDa,遠(yuǎn)小于Cas13a的130kDa,dCasE的小分子量更容易遞送至細(xì)胞內(nèi),因此更適合用于活細(xì)胞的RNA追蹤。

       一位接近韓春雨的人士透露:“這篇文章是此前韓春雨工作的延續(xù),目的都是開發(fā)基因編輯工具。”

       不過,值得注意的是,該研究目前發(fā)表于預(yù)印本網(wǎng)站,尚未經(jīng)過同行評(píng)議,

       對(duì)此,有科研人士指出,首發(fā)在未經(jīng)同行評(píng)議的預(yù)印本上,是為了獲得首發(fā)權(quán)。“韓春雨下一步還會(huì)投正式期刊的。”前述人士推測(cè)。

       不知道此次新的研究成果是否會(huì)再次給韓春雨帶來關(guān)注,2016年5月,《自然—生物技術(shù)》發(fā)表韓春雨團(tuán)隊(duì)新的基因編輯技術(shù)NgAgo,被媒體以“甘坐冷板凳、十年憋大招”的故事原型炒作而走紅,此后半年,韓春雨個(gè)人及其所在大學(xué)陸續(xù)獲得各類名譽(yù)和大量經(jīng)費(fèi)資助,但亦有國(guó)內(nèi)多名基因編輯領(lǐng)域科學(xué)家實(shí)名發(fā)聲稱實(shí)驗(yàn)結(jié)果難以重復(fù),懷疑實(shí)驗(yàn)結(jié)果的真實(shí)性。

       2017年8月,《自然—生物技術(shù)》發(fā)表題為《是該數(shù)據(jù)說話的時(shí)候了》社論,宣布撤回韓春雨團(tuán)隊(duì)于2016年5月2日發(fā)表在該期刊的論文。

       2018年9月,河北科技大學(xué)發(fā)布公告,韓春雨團(tuán)隊(duì)不存在主觀造假。但依據(jù)有關(guān)規(guī)定,取消韓春雨所獲得的榮譽(yù)稱號(hào),終止韓春雨團(tuán)隊(duì)承擔(dān)的科研項(xiàng)目并收回科研經(jīng)費(fèi)。

       韓春雨團(tuán)隊(duì)回應(yīng)稱,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)存在缺陷、研究過程存在著不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膯栴}。

       有業(yè)界人士表示:“這波之后,NgAgo這個(gè)研究方向在中國(guó)做得很慢。韓春雨他們的工作開展起來也比較困難,連學(xué)生也沒有新招。”

       

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