以連接組和空間轉(zhuǎn)錄組為代表的多組學(xué)研究已進(jìn)入單細(xì)胞分辨率時(shí)代，這需要具備單細(xì)胞水平空間定位能力的參考腦圖譜。然而，現(xiàn)有的腦圖譜都沒(méi)能做到單細(xì)胞可見的空間定位。
2025 年 7 月 2 日，海南大學(xué)/華中科技大學(xué)駱清銘院士、龔輝教授及加州大學(xué)洛杉磯分校董紅衛(wèi)教授團(tuán)隊(duì)（豐釗為第一作者）合作，在國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Nature 上發(fā)表了題為：A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究論文。
該研究以 1 微米的各向同性分辨率繪制了小鼠三維腦區(qū)和立體定位圖譜，該圖譜可為大型腦圖譜項(xiàng)目提供數(shù)據(jù)分析和可視化支持，有望成為一種多功能腦科學(xué)工具，用于在單細(xì)胞水平上研究整個(gè)大腦。
在這項(xiàng)最新研究中，研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)連續(xù)微光學(xué)切片斷層成像技術(shù)，以各向同性 1 微米的分辨率呈現(xiàn)了一套基于尼氏染色的小鼠全腦細(xì)胞結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)集。
通過(guò)整合多模態(tài)圖像，研究團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了小鼠大腦三維參考圖譜--STAM，提供了 916 個(gè)結(jié)構(gòu)的三維形貌，并能夠生成任意角度的 1 微米分辨率切片圖像。研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步開發(fā)了一個(gè)基于信息學(xué)的平臺(tái)，用于可視化和共享圖譜圖像，提供諸如腦切片配準(zhǔn)、神經(jīng)元回路繪制和智能立體定向手術(shù)規(guī)劃等服務(wù)。該圖譜可與廣泛使用的立體定位圖譜兼容，支持在二維空間中對(duì)相應(yīng)冠狀面進(jìn)行跨圖譜導(dǎo)航，并在三維空間中實(shí)現(xiàn)圖譜空間的跨圖譜空間映射。
通過(guò)為大型腦圖譜項(xiàng)目提供數(shù)據(jù)分析和可視化支持，該研究開發(fā)的 STAM 圖譜有望成為一種多功能的腦科學(xué)工具，用于在單細(xì)胞水平上研究整個(gè)大腦。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8
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