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CPHI制藥在線 資訊 抗體結(jié)合定量的技術(shù)進展與治療意義

抗體結(jié)合定量的技術(shù)進展與治療意義

來源:小藥說藥
  2025-07-15
抗體與其靶抗原的結(jié)合動力學(xué)是決定其生物學(xué)功能和作為新型生物治療藥物成功的關(guān)鍵因素。定義抗原抗體的相互作用和動力學(xué)對于理解抗體在治療應(yīng)用中的藥理學(xué)和藥效學(xué)特征至關(guān)重要。

       引言

       抗體與其靶抗原的結(jié)合動力學(xué)是決定其生物學(xué)功能和作為新型生物治療藥物成功的關(guān)鍵因素。定義抗原抗體的相互作用和動力學(xué)對于理解抗體在治療應(yīng)用中的藥理學(xué)和藥效學(xué)特征至關(guān)重要。

       抗體的功能與其結(jié)構(gòu)直接相關(guān),不同的結(jié)構(gòu)域能夠與抗原和免疫系統(tǒng)的其他元件相互作用。天然抗體由兩個片段抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域(Fab)和一個片段可結(jié)晶結(jié)構(gòu)域(Fc)組成。Fab結(jié)構(gòu)域包含互補決定區(qū)(CDR),其通過非共價相互作用介導(dǎo)抗體與靶標(biāo)的結(jié)合。傳統(tǒng)上,兩個抗體臂上的CDR是相同的,但目前已經(jīng)開發(fā)出多種新的形式,包括雙特異性抗體、三特異性抗體、抗體偶聯(lián)藥物(ADC)和免疫細胞因子等。

傳統(tǒng)上,兩個抗體臂上的CDR是相同的,但目前已經(jīng)開發(fā)出多種新的形式,包括雙特異性抗體、三特異性抗體、抗體偶聯(lián)藥物(ADC)和免疫細胞因子等。

       精準(zhǔn)確定抗體結(jié)合相互作用是早期發(fā)現(xiàn)工作的關(guān)鍵,靶點的性質(zhì)和候選抗體的適應(yīng)癥應(yīng)用可能決定親和力要求和靶點作用機制。與小分子不同,抗體可以與幾個治療靶點(包括Fc受體)相互作用,導(dǎo)致免疫效應(yīng)細胞的募集和激活,直接消除表達靶抗原的細胞??贵w還可以通過模仿天然多價配體、驅(qū)動受體聚集和反激活來誘導(dǎo)激動作用。這些不同的作用機制和日益復(fù)雜的新型抗體形式的出現(xiàn),使抗體親和力和功能效力之間關(guān)系的研究成為一項復(fù)雜的任務(wù)。

       一、抗體結(jié)合親和力與功能性親和力

       結(jié)合親和力(affinity)代表了兩個分子之間結(jié)合的緊密程度。它來源于結(jié)合和解離的速率,定義了復(fù)雜結(jié)構(gòu)的組裝和分解的速度。在抗體的背景下,靶結(jié)合親和力是指CDR與其抗原表位之間的相互作用,它來自抗體與靶標(biāo)解離速率常數(shù)(Koff)和結(jié)合速率常數(shù)(Kon)的比值。

       結(jié)合親和力也可以來自其他抗體結(jié)構(gòu)域,如Fc區(qū)。由于這些恒定結(jié)構(gòu)域的高度序列同源性,相互作用強度通常是一致的,主要在抗體同種型或Fc受體多態(tài)性之間觀察到顯著差異??贵w對其抗原的親和力和特異性是由非共價相互作用驅(qū)動的,包括氫鍵、范德華力和抗體CDR中氨基酸殘基介導(dǎo)的靜電相互作用。具有相似結(jié)合親和力的抗體可能具有不同的動力學(xué)。因此,在考慮觀察到的治療效果時,了解影響KD值的個體動力學(xué)速率常數(shù)是非常重要的。

       由于抗體的二價形式,抗體同時與兩種不同的抗原結(jié)合,這一概念被稱為功能性親和力(avidity)。功能性親和力代表抗體-抗原相互作用的整體強度,受三個因素的影響--結(jié)合親和力(Affinity)、價數(shù)和抗體與抗原的結(jié)構(gòu)排列。功能性親和力來源于結(jié)合位點的共定位,抗體的兩個CDR結(jié)合到同一靶標(biāo)上,如細胞膜上的抗原。這可以表現(xiàn)為結(jié)合親和力的明顯增加,這是由增強的再結(jié)合潛力引起的,因為第二個Fab:抗原相互作用可以在主要復(fù)合物解離之前發(fā)生。

抗原相互作用可以在主要復(fù)合物解離之前發(fā)生。

       親和力增加可能出于兩個原因。首先,抗體的兩個臂都與空間相關(guān)的位點結(jié)合,為了完全解離,兩個臂必須釋放其抗原,導(dǎo)致有效的解離半衰期比單獨的抗體臂長得多。其次,當(dāng)與細胞表面相關(guān)抗原結(jié)合時,抗體在空間上受到限制。一個潛在的后果是,第二次結(jié)合事件是由細胞表面上第二拷貝抗原的局部可用性來決定的。因此,功能性親和力可以被視為一種協(xié)同作用,其中一個臂的結(jié)合會導(dǎo)致另一個臂結(jié)合動力學(xué)的變化。細胞膜上更高有效抗體濃度的親和力效應(yīng)將取決于細胞密度和抗原表達水平。

       當(dāng)目標(biāo)是最大限度地提高靶參與度,以拮抗靶抗原的生物功能時,功能性親和力可能是有利的。然而,當(dāng)目標(biāo)指向免疫系統(tǒng)時,如ADCC和ADCP,這種抗體二價的作用是非常有限的。實驗觀察表明,單價或具有較低內(nèi)在親和力的工程抗體可能更有效,表現(xiàn)出明顯增加的Emax,這是由于與細胞膜結(jié)合的抗體增加。

       二、抗體-抗原相互作用的調(diào)節(jié)

       近年來,人們已經(jīng)探索出幾種調(diào)節(jié)抗體靶點結(jié)合的方法。通過提高抗體親和力或改變價態(tài)并引入額外的功能域來實現(xiàn)抗體與靶點的更強結(jié)合。

       抗體序列工程化調(diào)節(jié)抗體靶親和力

       抗體親和力調(diào)節(jié)的最早時間點是在抗體發(fā)現(xiàn)階段。傳統(tǒng)上,抗體親和力的調(diào)節(jié)可以通過體外噬菌體、酵母和哺乳動物基于展示的抗體發(fā)現(xiàn)模型來實現(xiàn)的。親和力調(diào)節(jié)可以通過使用這些方法進行親和力成熟來實現(xiàn),引入突變以產(chǎn)生具有操縱靶結(jié)合親和力的突變庫,此外,可以通過引入更苛刻的洗滌條件來選擇高親和力抗體。

       此外,通過體內(nèi)技術(shù)可以實現(xiàn)的高親和力抗體的發(fā)現(xiàn)。通過調(diào)節(jié)免疫方案,包括免疫抗原、佐劑、預(yù)處理、免疫方案、給藥途徑和靶生物的形式,以最大限度地刺激高親和力抗體的產(chǎn)生,然后通過B細胞克隆技術(shù)篩選高親和力抗體。進一步的創(chuàng)新包括使用表達人源抗體的轉(zhuǎn)基因動物,這些抗體能夠以高親和力結(jié)合靶點,并具有更大的臨床轉(zhuǎn)化前景。

       基于AI的親和力優(yōu)化

       二代測序(NGS)通過基于序列相似性和特征識別可能編碼高親和力抗體的核酸,增強了對高親和力抗體發(fā)現(xiàn)的能力,允許以前所未有的規(guī)模篩查編碼核酸的抗體。此外,人工智能和基于機器的學(xué)習(xí)(AI/ML)增強了NGS以更高的精度篩選更多高親和力結(jié)合序列的能力,并證明了其在抗體、基因聚類、從頭設(shè)計、優(yōu)化和調(diào)節(jié)結(jié)合親和力方面的能力。

       通過抗體結(jié)構(gòu)工程化調(diào)節(jié)靶點結(jié)合

       除了靶親和力之外,通過改造天然單特異性形式之外的結(jié)構(gòu),可以增強抗體與靶的結(jié)合,包括在單個分子內(nèi)配對兩組不同的CDR以產(chǎn)生雙特異性抗體。此外,功能結(jié)構(gòu)域的引入導(dǎo)致了更復(fù)雜的形式的發(fā)展,如三特異性抗體和免疫細胞因子。

       三、測量抗體-抗原相互作用的方法

       準(zhǔn)確測量抗體親和力,理解結(jié)合動力學(xué),可以有效指導(dǎo)藥物開發(fā)??贵w-抗原互相作用的測定方法大致可以分成兩大類:一類是把其中一個分子(通常是抗原)固定在芯片或者板子上,然后測定另一個分子(抗體)的結(jié)合參數(shù),比如SPR、BLI。另一類是直接在活細胞上做實驗,看抗體怎么結(jié)合到細胞表面,比如流式細胞術(shù)、KinExA等等。

       表面等離子共振(SPR)

       SPR被廣泛用于實時測量抗體與固定抗原、補體或Fcγ受體的結(jié)合動力學(xué)。這種高通量、無標(biāo)記的技術(shù)提供了對抗體-抗原結(jié)合動力學(xué)的詳細分析,包括結(jié)合率和解離率。通過固定任一結(jié)合伴侶。結(jié)合和解離事件會改變固定分析物的金膜芯片的折射率,從而導(dǎo)致可以實時測量的光散射強度的變化。

       然而,在將體外和體內(nèi)發(fā)現(xiàn)相關(guān)聯(lián)時,SPR可能缺乏生理相關(guān)性。固定化的細胞表面抗原可能無法在細胞膜內(nèi)準(zhǔn)確復(fù)制其三維結(jié)構(gòu),溶液中的天然抗原相互作用受到固定化的限制,從而限制了觀察到的相互作用自由度。此外,SPR中使用的緩沖條件可能無法準(zhǔn)確反映pH、溫度或成分方面的生理結(jié)合環(huán)境。

       流式細胞術(shù)

       細胞計量學(xué)細胞結(jié)合試驗用于針對固定數(shù)量的表達靶抗原的細胞進行抗體滴定。這些檢測使用熒光標(biāo)記的配體或標(biāo)記的第二抗體來檢測結(jié)合,從而可以確定達到半數(shù)結(jié)合的濃度(EC50)和最大結(jié)合,這可以提供對抗體結(jié)合機制的見解。

       設(shè)計細胞結(jié)合方法時有幾個考慮因素,包括配體耗竭和平衡。基于細胞術(shù)的檢測的其他局限性包括抗原:抗體復(fù)合物內(nèi)化,導(dǎo)致觀察到的抗體結(jié)合減少。

       動力學(xué)排斥試驗

       動力學(xué)排斥試驗(KinExA)是一種基于溶液的試驗,用于確定免疫復(fù)合物的結(jié)合伴侶濃度和平衡解離常數(shù)。在抗體親和力測量中,靶抗原被恒定濃度的抗體結(jié)合位點,使其平衡,隨后在流動中暴露于抗原包被的珠粒中。用熒光偶聯(lián)的二抗檢測珠捕獲的抗體,從而能夠在平衡時定量游離抗體并測定抗體親和力。由于這種測定通??梢赃_到平衡,因此被認(rèn)為更適合測量高親和力、亞納摩爾的相互作用。

       四、抗體親和力與功能的關(guān)系

       抗體對其靶標(biāo)的親和力通常被認(rèn)為與其誘導(dǎo)藥理作用的能力密切相關(guān)。然而,這種相關(guān)性并不完全是線性的,并且高度依賴于所討論的特定藥理作用,以及它是否是由于靶細胞表面的靶占據(jù)或抗體密度引起的。

抗體對其靶標(biāo)的親和力通常被認(rèn)為與其誘導(dǎo)藥理作用的能力密切相關(guān)。

       緊密結(jié)合及其對抗體功能的影響

       高親和力抗體通常會與其靶抗原表現(xiàn)出"緊密結(jié)合",其特征是當(dāng)抗體濃度遠低于抗原濃度時,仍能有效結(jié)合,導(dǎo)致游離抗體被耗盡。通常抗體親和力與其藥理學(xué)效果密切相關(guān),但親和力與功能的關(guān)系并非總是簡單的線性關(guān)系,其取決于具體機制和效應(yīng)來源。

       拮抗性抗體

       拮抗性抗體通過直接受體結(jié)合或隔離激活配體來破壞受體信號傳導(dǎo)??梢酝ㄟ^觀察靶受體激活的下游效應(yīng)來評估它們的功能,包括從測量信號事件(如配體結(jié)合后不久的受體磷酸化)到對細胞增殖或表型的下游影響。通常靶標(biāo)親和力和效力之間呈線性關(guān)系,更高親和力的抗體能夠在較低濃度下引發(fā)它們的作用。此外,這里可能存在一些表位依賴性,因為與受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域結(jié)合的抗體比與更遠端表位結(jié)合的抗體更有效。

       免疫細胞接合器

       參與抗體的免疫細胞涵蓋了廣泛的作用機制,所有這些機制都會誘導(dǎo)靶細胞的細胞毒性,例如通過ADCC、ADCP或CDC。除了這些傳統(tǒng)的Fc介導(dǎo)的效應(yīng)器功能外,還包括了T細胞和NK細胞結(jié)合器,通過Fab介導(dǎo)的靶向特定效應(yīng)細胞免疫受體來招募免疫細胞。

       通常在這些復(fù)雜的作用機制中,親和力和功能之間的關(guān)系并沒有明確界定,其中抗體靶結(jié)合與補體或FcγR結(jié)合和/或免疫細胞結(jié)合是同時需要的。對于Fc依賴性細胞毒性機制,高親和力抗體可能導(dǎo)致雙價結(jié)合,占用兩個抗原但只提供一個Fc,降低效應(yīng)細胞募集效率。相比之下,親和力較低的抗體更有可能以單價結(jié)合,導(dǎo)致更大的細胞調(diào)理、Fc呈遞,從而導(dǎo)致免疫細胞和補體募集。

       雙特異性T細胞和NK細胞接合器的功能活性受TAA和T/NK細胞靶向域親和力的調(diào)節(jié)。對TAA的親和力必須足夠高才能與靶標(biāo)結(jié)合,但必須仔細考慮對CD3的親和力,以平衡細胞毒性作用,同時降低與細胞因子釋放相關(guān)的風(fēng)險。

       激動劑抗體

       激動劑抗體利用其二價性質(zhì)促進其靶標(biāo)在靶細胞膜或溶液中的聚集。通過這種方式,它們可以模仿天然存在的配體,誘導(dǎo)受體激活或靶標(biāo)交聯(lián)。

       抗體親和力和激動活性之間的關(guān)系尚未像拮抗抗體那樣得到廣泛的研究。一項研究調(diào)查了靶向三種不同受體(PD-1、CD40和4-1BB)的激動性抗體的親和力和功能關(guān)系,這些受體需要聚集才能引發(fā)其激動活性。該研究表明親和力和功能之間存在鐘形關(guān)系,低親和力而非高親和力是由更快的解離速率驅(qū)動的,導(dǎo)致最大的激動作用。此外,還觀察到除親和力之外的抗體的其他特性會影響體外效力,包括鉸鏈靈活性和對Fab構(gòu)象的影響。

       抗體偶聯(lián)藥物

       ADC的結(jié)構(gòu)很復(fù)雜,其功效受到其物理化學(xué)性質(zhì)和生物學(xué)特征的影響,如細胞內(nèi)化、有效載荷釋放和有效載荷的作用機制。連接子-有效載荷與抗體的結(jié)合,無論是通過共價還是非共價修飾,都會改變ADC的物理化學(xué)特性。

       一般來說,高親和力可能提高細胞內(nèi)吞和載荷釋放效率,但也可能增加脫靶毒性。而低親和力可能減少脫靶結(jié)合,但也可能降低腫瘤細胞攝取效率。親和力的選擇需要平衡靶向性、內(nèi)吞、載荷釋放和安全性等各方面。

       結(jié)語

       抗體結(jié)合定量技術(shù)的快速發(fā)展為精準(zhǔn)治療和藥物研發(fā)開辟了新的可能性。通過對抗體親和力與功能性親和力的深入理解與優(yōu)化,結(jié)合AI技術(shù)、序列工程和功能域設(shè)計,我們不僅能夠提升抗體的治療效力和靶向性,還能顯著降低副作用風(fēng)險。未來,隨著跨學(xué)科技術(shù)的融合與創(chuàng)新,抗體療法有望在癌癥、自身免疫疾病和感染性疾病等領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)更突破性的進展,最終為患者提供更安全、更個性化的治療方案。這一領(lǐng)域的持續(xù)探索,將深刻影響生物醫(yī)藥的發(fā)展方向與臨床實踐。

       參考資料:

       1.Quantifying antibody binding: techniques and therapeutic implications. MAbs. 2025 Feb 16;17(1):2459795

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